У нас тоже была такая проблема, редко какая кошка или кот спокойно отнесется к манипуляциям с собой. Приходилось для того, что бы закапать глаз нашему старому коту пеленать его в полотенце как новорожденного. Муж держал, а я капала, ну а кот вырывался, как мог, закапать получалось, наверное, раза с третьего.